病毒性病原体主要有禽流感（正黏病毒）、新城疫（副黏病毒）、传支（冠状病毒）、传喉（疱疹病毒）等。

细菌性病原体主要有传染性鼻炎（嗜血杆菌）、大肠杆菌。

其他类病原体主要有慢呼（支原体）、曲霉菌病（曲霉菌）。

其他病原体的干扰呼吸道疾病的病原体除细菌、霉形体、病毒外，还有造成免疫抑制的疾病，如鸡马立克病、传染性贫血病、传染性法氏囊炎、网状内皮增生症、亚型白血病、呼肠孤病毒病等，以及不利的环境因素，加重了病原体对呼吸道的致病作用。